Gal4 erkennt Gene mit UAS G, einer vorgeschalteten Aktivierungssequenz, und aktiviert sie. In Hefezellen sind die wichtigsten Ziele GAL1 (Galaktokinase), GAL10 (UDP-Glukose-4-Epimerase) und GAL7 (Galaktose-1-Phosphat-Uridylyltransferase). Gal4 wird standardmäßig durch Gal80 unterdrückt und in Gegenwart von Galaktose aktiviert.
Domänen
Zwei ausführende Domänen, die DNA-Bindungsdomäne und die Aktivierungsdomäne, stellen eine Schlüsselfunktion des Gal4-Proteins dar, die den meisten Transkriptionsfaktoren entspricht. Gal4 spielt eine Schlüsselrolle bei der Regulierung der Transkription im menschlichen Körper. Es wird vermutet, dass Gal4 für die Entwicklung des menschlichen Genoms verantwortlich ist.
Der N-Terminus von Gal4 ist ein Zinkfinger und gehört zur Pilzfamilie Zn(2)-C6. Er bildet ein Zn-Cystein-Thiolat-Cluster. Gal4 erkennt spezifisch das UAS G im GAL1-Promotor.
Verordnung
Galaktose induziert die Gal4-vermittelte Transkription, obwohl Glukose eine starke Unterdrückung bewirkt. Das inhibitorische Protein Gal80 wird durch das regulatorische Protein Gal3 in einer galaktoseabhängigen Weise sequestriert. Die Gal4-Aktivierungsdomäne wird in einigen Gal4-Konstrukten durch die C-terminale Domäne gehemmt. Die Gal4-Loss-of-Function-Mutante gal4-64 verlor sowohl die Interaktion mit Gal80 als auch die Aktivierungsfunktion.